Rodzinny nowotwór związany z polimorfizmem w ARLTS1 czesc 4

Mutacja G446A (Trp149Stop). Panel A pokazuje mutację linii zarodkowej G446A (Trp149Stop) (sekwencje są w orientacji odwrotnej). Szybki test został opracowany za pomocą strony MaeI wprowadzonej przez mutację. DNA amplifikowano za pomocą przedniego startera zawierającego zmianę zasady w celu zniszczenia konstytutywnego miejsca MaeI i strawiono 2 U MaeI (Boehringer). Amplifikacja normalnego allelu powoduje powstanie pojedynczego produktu o 138 bp, podczas gdy zmutowany allel wytwarza dwa prążki (jeden 106 bp i jeden 32 bp). Continue reading „Rodzinny nowotwór związany z polimorfizmem w ARLTS1 czesc 4”

Rodzinny nowotwór związany z polimorfizmem w ARLTS1 cd

Wszystkie sekwencjonowane konstrukty transfekowano za pomocą FuGENE6, zgodnie z instrukcjami producenta (Boehringer Mannheim). Stabilnie transfekowane komórki selekcjonowano przy użyciu G418 i badano pod kątem transformowanego fenotypu przez ustalenie rakotwórczości in vivo u nagich myszy Nu / Nu i wyselekcjonowano do apoptozy z użyciem zestawu apoptozy monoklonalnego przeciwciała czynnej kaspazy-3 phycoerytrine (Pharmingen, BD Biosciences ). Profile cyklu komórkowego identyfikowano za pomocą cytometrii przepływowej komórek barwionych jodkiem propidyny, a profile ekspresji genów określano przy użyciu bioarray ekspresji Kimmel Cancer Center / Thomas Jefferson University 18.5K (Compugen Human Oligo Set 1.0) , jak opisano wcześniej.17 Analiza statystyczna
Analizę statystyczną wyników jakościowych przeprowadzono za pomocą dokładnego testu Fishera. Model logistyczno-regresyjny został wykorzystany do określenia ilorazu szans na raka w powiązaniu z konkretnymi mutacjami. Masy nowotworów u myszy z niedoborem odporności zbadano w modelu analizy wariancji, który obejmował grupę leczoną i czas, w którym zwierzę zostało zabite; Obliczono dwustronne wartości P dla określonych porównań między grupami. Continue reading „Rodzinny nowotwór związany z polimorfizmem w ARLTS1 cd”

Rodzinny nowotwór związany z polimorfizmem w ARLTS1 ad

Okazy raka jelita grubego i idiopatycznej pancytopenii pochodziły od pacjentów w Bukareszcie, w Rumunii; okazy raka piersi pochodziły od pacjentów w Ferrarze we Włoszech (38 okazów) i Aarhus w Danii (10 okazów); próbki CLL pochodziły od pacjentów nadzorowanych w konsorcjum CLL w Stanach Zjednoczonych; próbki raka płuca pochodziły także od pacjentów w Ferrara; a próbki nowotworu tarczycy pochodziły od pacjentów w Neapolu we Włoszech. Uzyskaliśmy 109 próbek krwi obwodowej od pacjentów z rakiem rodzinnym lub mnogim: obejmowały one 69 kobiet z rodzinnym rakiem piersi z niedoborem BRCA1 i BRCA2, 17 mężczyzn z rakiem prostaty i czerniakiem złośliwym (negatywny w przypadku mutacji w genie p16), 17 pacjenci z rodzinną CLL (co najmniej dwóch krewnych pierwszego stopnia dotkniętych chorobą) i 6 pacjentów z rakiem trzustki lub czerniakiem (bez mutacji w genie p16 lub p14 i wywiadem rodzinnym co najmniej jednego przypadku raka trzustki lub czerniaka). Pobrano próbkę od tylko jednego chorego członka na rodzinę. Rodzinne próbki CLL pochodziły od pacjentów w Paryżu (11 okazów) i konsorcjum CLL w Stanach Zjednoczonych (6 okazów). Wszystkie inne próbki od pacjentów z rakiem rodzinnym lub mnogim pochodziły z Filadelfii. Continue reading „Rodzinny nowotwór związany z polimorfizmem w ARLTS1 ad”

Rodzinny nowotwór związany z polimorfizmem w ARLTS1

Stwierdzenie hemizygotycznych lub homozygotycznych delecji w paśmie 14 na chromosomie 13 w różnych nowotworach sugeruje obecność locus supresorowego guza telomerycznego względem genu RB1. Metody
Badaliśmy próbki od 216 pacjentów z różnymi typami sporadycznych guzów lub idiopatycznej pancytopenii, próbki krwi obwodowej od 109 pacjentów z rodzinnym rakiem lub wieloma nowotworami, i kontrolowaliśmy próbki krwi od 475 zdrowych ludzi lub pacjentów z chorobami innymi niż rak. Przeprowadziliśmy badania funkcjonalne linii komórkowych pozbawionych ekspresji ARLTS1 przy użyciu zarówno pełnej długości genu ARLTS1, jak i skróconego wariantu.
Wyniki
Znaleźliśmy gen w 13q14, ARLTS1, członek rodziny czynnika ADP-rybozylacji, o właściwościach genu supresorowego guza. Przeanalizowaliśmy 800 próbek DNA z nowotworów i komórek krwi od pacjentów ze sporadycznymi lub rodzinnymi nowotworami i kontrolnymi i odkryliśmy, że częstotliwość bezsensownego polimorfizmu, G446A (Trp149Stop), była podobna w grupie kontrolnej iu pacjentów z guzami sporadycznymi, ale była znacznie częstsza wśród pacjentów z rakiem rodzinnym niż wśród pozostałych dwóch grup (P = 0,02; iloraz szans, 5,7; przedział ufności 95%, 1,3 do 24,8). Continue reading „Rodzinny nowotwór związany z polimorfizmem w ARLTS1”

Koszty instytucjonalnych komisji rewizyjnych w Akademickich Centrach Medycznych

Listy Ważną kwestią związaną z ochroną ludzkich uczestników badań jest to, że instytucjonalne zespoły przeglądowe (IRB) mają niewystarczające zasoby1. Jednak niewiele jest doniesień o faktycznych kosztach oceny IRB.2-4 Aby oszacować koszty funkcjonowania akademickich IRB w 2002 r. , przeprowadziliśmy ankietę przy wsparciu Fundacji Charytatywnej Doris Duke i Burroughs Wellcome Fund. Przeanalizowaliśmy 121 amerykańskich szkół medycznych z aktywnymi IRB; Odpowiedziało 63 przedstawicielstw. Instytucje dokumentowały edukację, doświadczenie i stanowiska pracowników IRB; skład samej IRB; szacunkowe ilości czasu poświęconego na różne działania; koszty sprzętu, zaopatrzenia, podróży i przestrzeni; oraz korzystanie z usług zewnętrznych. Continue reading „Koszty instytucjonalnych komisji rewizyjnych w Akademickich Centrach Medycznych”